PhenoSem de PHENOTIC - Phénotypage des semences et plantules
Session thématique #01Sciences et technologies de l'information et de la communication au service du végétal spécialisé
- 15h15 - 17h30
- Didier Demilly - GEVES, Angers
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Co-auteur(s) : Didier Demilly 2, Sylvie Ducournau 1,2, Karima Boudehri 1,2, Marie-Hélène Wagner 1,2, Carolyne Dürr 1,3
Au sein de la plateforme PHENOTIC Semences et Plantes, l’offre Phenosem développe des méthodes de phénotypage sur semences et plantules et propose la réalisation de phénotypage. Différents équipements d’imagerie et l’extraction automatisée de caractéristiques biologiques à partir des images visent à assurer un continuuum de caractérisation de la semence sèche, de la dynamique d’imbibition, de la germination et de la dynamique de croissance des organes de la jeune plantule, à haut débit, dans des conditions environnementales variées et sur une large gamme d’espèces. Ces équipements font appel à l’imagerie couleur conventionnelle, la radiographie RX (y compris tomographie 3D), l’imagerie multispectrale, la fluorescence de la chlorophylle, l’automatisation d’acquisition de séries temporelles d’images (bancs de germination, bancs de croissance hétérotrophe des jeunes plantules). Les techniques d’imagerie hyperspectrale, de thermographie infra rouge, RMN, ou biospeckle permettent du phénotypage plus précis ou plus complet.
Les capacités de phénotypage (jusqu’à 7000 semences simultanément pour la germination) sont utilisées pour contrôler la qualité des lots de semences (qualité intrinsèque des semences, apport des traitements, priming, etc), pour étudier l’adaptation aux changements climatiques et à de nouvelles conditions de semis (variabilité génotypique, prédiction de la levée au champ), en lien avec l’étude du déterminisme génétique (QTL), ou pour caractériser de nouvelles espèces, variétés, collections de génotypes (intérêt de différentes espèces pour l'inter-cultures, ressources génétiques…).
1 SFR 4207 Quasav - Université d’Angers, 40 rue de Rennes, BP 7353 - 49035 Angers cedex 01
2 GEVES - 25 Rue Georges Morel , CS 90024 - 49071 Beaucouzé cedex
3 INRA - 42, rue Georges Morel, BP 6005 - 49071 Beaucouzé