Communication

PhenoSem de PHENOTIC - Phénotypage des semences et plantules

Session thématique #01
Sciences et technologies de l'information et de la communication au service du végétal spécialisé
Poster

Co-auteur(s) : Didier Demilly 2, Sylvie Ducournau 1,2, Karima Boudehri 1,2, Marie-Hélène Wagner 1,2, Carolyne Dürr 1,3

Au sein de la plateforme PHENOTIC Semences et Plantes, l’offre Phenosem développe des méthodes de phénotypage sur semences et plantules et propose la réalisation de phénotypage. Différents équipements d’imagerie et l’extraction automatisée de caractéristiques biologiques à partir des images visent à assurer un continuuum de caractérisation de la semence sèche, de la dynamique d’imbibition, de la germination et de la dynamique de croissance des organes de la jeune plantule, à haut débit, dans des conditions environnementales variées et sur une large gamme d’espèces. Ces équipements font appel à l’imagerie couleur conventionnelle, la radiographie RX (y compris tomographie 3D), l’imagerie multispectrale, la fluorescence de la chlorophylle, l’automatisation d’acquisition de séries temporelles d’images (bancs de germination, bancs de croissance hétérotrophe des jeunes plantules). Les techniques d’imagerie hyperspectrale, de thermographie infra rouge, RMN, ou biospeckle permettent du phénotypage plus précis ou plus complet.

Les capacités de phénotypage (jusqu’à 7000 semences simultanément pour la germination) sont utilisées pour contrôler la qualité des lots de semences (qualité intrinsèque des semences, apport des traitements, priming, etc), pour étudier l’adaptation aux changements climatiques et à de nouvelles conditions de semis (variabilité génotypique, prédiction de la levée au champ), en lien avec l’étude du déterminisme génétique (QTL), ou pour caractériser de nouvelles espèces, variétés, collections de génotypes (intérêt de différentes espèces pour l'inter-cultures, ressources génétiques…).

Illustration
Bancs de germination, semences de betteraves en cours de germination, tomographe RX, visualisation 3D de semences obtenue par tomographie RX, Videometer, détection de fusariose sur blé tendre à partir de l’imagerie multispectrale du videometer

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